Il laboratorio è dotato di 16 postazioni con monitor collegati ad un microscopio ottico a fluorescenza (NIKON "ECLIPSE" Mod. 80i) e ad un microscopio stereoscopico (NIKON SMZ-1000 8X-80X) da ricerca tramite un sistema di distribuzione VIDEO DIGITALE NIKON mod. DS-2Mv. Le funzionalità e le attività svolte presso questo laboratorio sono relativa all'analisi tassonomica di singoli organismi di piccole dimensioni del benthos e del plancton, alla composizione dei popolamenti e comunità di organismi della micro-, meio- e macro-fauna e flora marina, all'analisi microscopica di cellule, tessuti e organi di organismi marini. Le finalità didattiche del laboratorio sono di fornire agli studenti tecniche e strumenti analitici per l'osservazione della diversità microscopica marina e le abilità ad interpretare e descrivere in modo critico le strutture microscopiche degli esseri viventi marini a differenti livelli di complessità e organizzazione.